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Nanjing baiyike Biotechnology Co., Ltd

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CUT-Tag技术服务
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发布日期:2021-08-16
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关 键 词:蛋白,核酸,互作,转基因,抗体
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详细介绍

CUT-Tag技术服务

介绍:CUT&Tag是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,是一种使用protein-A-TnS转 座体融合蛋白的连接方法。在CUT&Tag中,通透性细胞或细胞核与特定染色质 蛋白的抗体孵育,然后负载嵌镶末端接头的pA-TnS被连续地连接到抗体结合位 点。通过添加镁离子激活转座体,导致接头整合到附近的 DNA。然后这些基因被 扩增,生成 测序库,适用千无ChlP级别抗体的蛋白研究。有望将蛋白质-DNA互 作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作,经过PCR扩增后形成可以直接用于高通量测序的文库,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。

技术原理

ChiTag是Protein A蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白,当抗体结合目的蛋白(如转录因子、组蛋白等)后,Protein A蛋白可直

接结合抗体,携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA片段,并将DNA片段连上接头,文库构建之后可进行高

通量测序。

技术优势

样品起始量低:能够对及少量样品进行分析,可兼容低至60个细胞甚至单胞

超高活性:兼具pG/A &TnS活性,DNA 片段化活性极高

信噪比高:背景噪音低,所需测序深度少,信噪比显著优于Ch IP-Seq

实验重复性好:平行样本之间的重复性好。实验重复结果保持一致

CUT&Tag与ChIP-Seq流程比较

CUT&Tag

ChIP-Seq

细胞渗透性处理

甲醛交联渗透细胞

一抗与目的蛋白结合,二抗与一抗结合

细胞破碎,收集裂解液

pA-Tn5转座子与抗体结合

超声打断基因组DNA

激活转座子,片段化目的蛋白局部DNA

加入一抗与ProteinA磁珠,进行免疫沉淀

提取DNA,PCR,建库完成,高通量测序

洗脱,解交联


DNA补平,加A,加平头


PCR,建库完成,高通量测序

实验步骤

Western blot 检测收集细胞细胞与磁珠结合目标蛋白与抗体共孵育片段化DNA 提取文库构建及扩增NGS 测序分

交付材料

CUT&Tag 检测,提供测序原始数据、分析报告、试验报告等;

实验报告(包括实验过程、检测结果等)。

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